Jill Valentine de Raccoon City, llevándonos a un argumento que se desarrollará durante 24 horas antes a lo visto en Resident Evil 2, durante lo transcurrido en el juego y tras él. La urbe, ahora infestada por no muertos surgidos tras la fuga del virus T de Umbrella, es un lugar impracticable y caótico. Mientras Jill intenta escapar, pronto se dará cuenta de que es el objetivo de una criatura biológica diseñada para matarla a ella, Nemesis, y a todos los supervivientes de los S.T.A.R.S., y que nos pondrá las cosas difíciles en el juego. En el camino, y entre las calles, la aguerrida agente de élite deberá sobrevivir a la pesadilla mientras se topa con los equipos de la Umbrella Biohazard Countermeasure Service (U.B.C.S.), siendo Carlos Oliveira su mejor aliado y única esperanza de

salir con vida.